启动APP

用户在R console中可以使用如下命令启动app, 然后在浏览器中访问网址127.0.0.1:8081使用app.

scSpotlight::run_app(options = list(port = 8081, host = "0.0.0.0"))

scSpotlight的默认启动模式是processing. 用户可以切换到viewer模式, 仅仅作分群的展示和查看基因表达.

scSpotlight::run_app(options = list(port = 8081, host = "0.0.0.0"), runningMode = "viewer")

如果载人的数据较大, 可以使用dataDir参数指定存放数据的位置. 此时data loading部分会变成下拉菜单, 用户可以从菜单选取需要载入的Rds文件.

scSpotlight::run_app(options = list(port = 8081, host = "0.0.0.0"), runningMode = "viewer", dataDir = "/path/to/data_directory")